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系统选育属本品种选育的一种高级形式，是指在统一指挥、统一组织下进行的一种有目的、有计划、有步骤的本品种选育。由于开展系统选育目的明确、标准一致、步调统一、规模宏大、范围宽广、力度强劲、进展迅速，可使品种或群体迅速一致地朝着人们预期的方向变化和发展，使人们当时认为具有的有益性状或性能及其表现突出的个体的比例迅速增加。使那些具有别的，特别是当时人们尚未意识到的，属于具有有益或未来可能十分有用的性状或性能的个体，由于反复严格淘汰而迅速减少或消失，也使许许多多具有支配这些性状性能形成和发育的基因或基因组在品种或群体的基因库中很快被淘汰。鉴于这种情况，若在保种地区对于属于地方良种的绵、山羊也像对于高度培育品种和要用于杂交的羊群那样进行大规模的强劲有力的系统选育，无疑必然将使品种或群体在遗传性的方面迅速丧失其多样性和丰富性。这样，不仅会使保种失去真正的意义，同时，也必然会因许许多多可能属于非常有用而当时还未被人们认识的基因或基因组的丧失，给未来的肉羊育种造成永久的遗憾和无可挽回的损失。
为果树生产培育大量纯正优质种苗的制度与方法。良种繁育是品种选育程序的一个组成部分，它的任务是提供符合国家标准的果树苗木；提高种性，防止品种退化；加速繁殖，提高繁殖系数。
措施和方法
建立包括品种母本园、砧木母本园和育苗圃三部分的良种繁育圃。母本园是提供繁殖材料的基地，对保证品种纯度，提高苗木质量，以及对以后的果树生产都有重要作用。母本园里的植株要经常观察选择，及时作出标记与记录，作为选优汰劣的依据。良种母本园又可以分为接穗母本园、自根繁殖母本园和实生繁殖母本园等。分别提供繁殖过程中所需要的接穗、插条、芽苗、茎尖及种子等。母本园应根据需要和可能进行新建和改建。对母本园的要求是①品种纯正，砧木和授粉品种适宜。②无病毒和检疫性病虫害，具有自然隔离或人工隔离的条件。③采用合理的农业技术措施，保障良种母本植株生长发育良好。砧木母本园分为实生繁殖砧木母本园和营养系砧木母本园。前者多在野生砧木资源分布丰富的地区，选择成片且典型的砧木林。间伐其它树种，淘汰不典型的类型，改建成自然群落的砧木母本园，并防止机械混杂和生物学混杂。以母本园中的良种、和砧木母本园提供的繁殖材料育苗，除常规方法之外，还可采用组织培养、热处理、微型嫁接、弥雾扦插等技术，培育无病毒苗和提高繁殖系数。
良种繁育的途径有：①扩大繁殖材料的来源。如扩大母树营养面积，增施水肥，加强修剪，控制结果，利用高接扩繁等措施；②经济利用繁殖材料，以短穗、单芽嫁接或扦插；③加强管理，早嫁接，早成苗，早出圃；④改进繁殖技术，延长繁殖时间。利用保护地育苗和茎尖培养等技术。
良种繁育制度
对品种纯度、苗木质量和病虫害程度可在生长期和休眠期进行鉴定，生长期鉴定即在新梢停止生长到落叶前进行，这阶段枝叶性状充分表现，品种特征明显，便于观察。鉴定分全样和抽样两种方式，前者沿每行顺序进行，后者划分检查区，每一检查区的面积1亩左右，取样点检查株数不得少于检查区内总株数的30%。鉴定项目包括枝、叶、芽的形态、色泽、茸毛、着生状态等，以及芽的萌动期，二次梢生长期、停止生长期、落叶期。发现异样植株及时挖除。休眠期鉴定，对芽、茎的形态特征等进行鉴定，淘汰不具备典型特征的苗木。
苗木质量鉴定制度
由于树种、品种、砧木和自然条件不同，苗木规格、分级标准各地稍有差异。一般优良种苗应具备以下共同特点①具有该品种典型性状和特性。②生长发育正常，茎干有一定的粗度和高度，组织成熟，充实。③整形带内有足够数量的饱满芽。④根系发达，有一定长度、粗度和侧根数。⑤嫁接部愈合良好，无明显坏死组织。⑥根颈部弯曲度小。⑦无严重机械损伤。不合出圃规格的苗木均予淘汰。
病虫害检疫制度
对国家规定的检疫性果树病虫害，进行严格检查，一旦发现，则苗木不能外运，同时采取防治、隔离或烧毁等措施。对常见病虫也要控制到最低程度，起运前喷铲除剂，减少病虫传播。符合标准的种苗签发种苗检验结果通知书（见表）。
按上述良种繁育方法培育，并严格地执行鉴定和检疫制度，就能保证获得品种纯正的优质苗木。
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